Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1P70338 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms