Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pitx1P70314 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx1P70314 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms