Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux2P70298 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cux2P70298 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms