Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms