Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbdsP70122 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms