Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms