Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfybP63139 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfybP63139 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfybP63139 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfybP63139 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms