Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms