Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39P62892 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms