Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl18aP62717 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms