Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbpl1P62340 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms