Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms