Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vbp1P61759 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vbp1P61759 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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