Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga11P61622 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms