Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc5P61460 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms