Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms