Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2fP61219 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms