Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms