Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms