Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps5P59438 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms