Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm2P58774 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms