Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms