Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp25P57080 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms