Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcd5P56812 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms