Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp1P56716 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp1P56716 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms