Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms