Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms