Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn5P54830 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms