Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms