Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp10P52479 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms