Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApodP51910 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApodP51910 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApodP51910 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApodP51910 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApodP51910 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms