Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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