Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RoraP51448 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RoraP51448 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms