Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms