Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms