Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TspoP50637 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TspoP50637 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TspoP50637 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TspoP50637 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms