Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms