Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc13P50207 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms