Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdhaP50136 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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