Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms