Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VdrP48281 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VdrP48281 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VdrP48281 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VdrP48281 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VdrP48281 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VdrP48281 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VdrP48281 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VdrP48281 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms