Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Resp18P47939 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Resp18P47939 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms