Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CratP47934 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CratP47934 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CratP47934 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CratP47934 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CratP47934 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CratP47934 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms