Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms