Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrprbP47758 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SrprbP47758 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SrprbP47758 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SrprbP47758 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms