Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax7P47239 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax7P47239 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax7P47239 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms