Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkn1bP46414 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms