Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syt1P46096 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms