Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tac1P41539 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tac1P41539 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms