Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfamP40630 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfamP40630 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TfamP40630 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TfamP40630 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TfamP40630 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms